抽象性
X联动性肾上腺假设NR0B1突变特征为虚数多效学和不孕症此处描述新奇病因子变换NR0B1与先天性肾上腺素相关联临床评价和编程绘制点变换 基因转换 大规模删除CYP21A2基因检验WES和隔离分析silco分析小说变异ACTH、17-Hydroxiroceonec和DHA硫酸盐值分别提升至624.6pg/mL、8.6pmol/L和17.8UMOL/LCYP21A2基因中没有发现突变WES辨识出新奇His73GlnfsTer41变量NR0B1基因致病效果 根据ACMG标准遗传测试帮助诊断初级肾上腺缺陷NR0B1可能是我们人口中先天性肾上腺虚伪的常见原因
开工导 言
NR0B1突变导致先天性肾上腺素伪症(CAP),作为一种稀有X相关失序症,估计流行率为1:140,000-1:1200,000一号..与X相联的先天性肾上腺缺损通常表现为从婴儿到幼童和极光多变性男性晚年不育[HHG]2..基因编码分解因子DAX1中心在发展肾上和生殖功能和轴中发挥重要作用3,4..NR0B1突变通常产生原创肾上腺不适和伪数多效学然而,有一些报告显示,病人的睾固酮水平提高[5,6..临床特征的严重程度包括因变异而出现肾上腺不适度和开始NR0B1显示肾上腺缺陷和生殖型个体有差异一号,7..模范类型通常由变异蛋白剩余活动产生8..
上百多变异报告NR0B1基因类http://www.hgmd.cf.ac.uk)约三分之一变异小因子作为轮廓变换描述伊朗高素数婴儿新式轮廓变换
二叉材料方法
2.1.采样和全Exom定序
小家庭受CAH影响儿子转介到中心病人经筛选所有前例和寄存器边界CYP21A2基因前没有检测到病原体变异签名后经RHC道德委员会批准从家属(健康/病人)获取的血液提取脱氧核糖核酸exome使用aglientSureSectExome抓包捕获浓缩Exon库排序由Illuma Hiseq 400执行(南韩首尔Macrogen公司)。
2.2.读映射、Snp/Indel调用和滤波
排序读法与BWA工具(v07.17)人类基因组参考法(GRCH37构建法)对齐九九..数据映射质量参考基因组98.8%,目标区域覆盖99%snp/indel调用GATK工具v4.4.1和结果文件映射标记清除复制件由SAM工具执行(GATK包件中)10..重新校准和snp/indel调用信差过滤并优先排序,原因有小异频(MAF>0.05)1000基因组、gnomad(v2.11)和ExAc[11数据库
2.3PCR和SangerNR0B
变式NR0B1基因排序应用PCR和Sanger排序法素数双机即5'ACTGGAGGATAC-3'和5'GCTGATTGTTGT-3'使用Primer3v.04.0设计验证http://bioinfo.ut.ee/primer3-0.4.0/和BLASThttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/index.cgi?LINK_LOC=BlastHome)Sanger测序使用BigDye终结器v3.1循环定序工具热渔科,上海,ABI序列3500XLPE
2.4.同义建模生物信息分析
同义建模用于获取三维结构模型NR0B1蛋白质,原因是缺少晶体结构用于该蛋白并评价突变对结构和功能的影响上头NR0B1从UnitProt数据库检索序列(UnitProtID:P51843)。SWISS-MODEL服务器https://swissmodel.expasy.org/)[12应用同族学建模蛋白FASTA序列作为输入提交,不分配约束和模板SWIS-MODEL模型结构目标蛋白并使用BLAST和HHblits组成节能li表示模型质量估计基于QMEAN评分,CAMEO监测SWIS-MODEL重叠的精度此外,生物信息分析应用算法评价检测变异的致病性CADD、SIFT、Polyphen2、Provean、Fathm和GERP等预测工具++使用中 。变式至少在4算法中被解读为致病性考虑确认/分离分析
3级结果
3.1.临床特征
病人(III-1)9个月的表兄弟情侣伊朗男孩egrie没有医疗问题历史1(a))婴儿9个月时介绍到中心 诊断CAH基因测试病人自出生以来的历史如下:他产子剖腹产,出生体重和长度分别为3.25公斤和53厘米,血糖自生命头几天以来一直处于正常水平。超比里鲁比症在出生后第二天观察到,并进行了四天光治释放数天后,他因呕吐和黄地再次入院(bilirubin=14 mg/dl)。开始测试电解层显示低抗拉(125mol/L钠)、超卡力卡片(7.5mol/L)和代谢酸化一号)医疗记录对缺血症和缺血症意义重大尽管用氯化钠和氟卓松进行了处理,但低温持续失肥 不良进食 呕吐 并查封但没有畸形生殖器和特征ACTH、17-Hydroxiroceonec和DHA硫酸盐值分别提升至624.6pg/mL、8.6pmol/L和17.8UMOL/L病人显示高水平睾固酮
(a)
(b)
3.2遗传调查
过滤WES数据后,小说hemizygours框架插入c218_219insACA:p.His73GlnfsTer41NR0B1基因识别 可能CAH在这个家族218_219INCA隔离分析结果显示,CAH继承这个家庭与X相关休眠模式一号)
最佳NR0B1模型完全设计使用3f5c.1,原因是SWISS-MODEL模板库名列前茅79%标识QMEAN分数-4.08表示模型比本地低误差分可靠NR0B1蛋白因p.His73Glnfstra2)give American医学遗传学院201514218_219insACA确定为致病变量,即标准:PVS1、PM2、PP4、PP1和PP3CADD、SIFT、Polyphen2、Provean、Fathm++.
4级讨论
原生肾上不适性(PAI)系一组可能威胁生命的病理学多变性失常以急发式PAI为特征,X联动先天性adreNR0B1变异引导CAP在此描述新奇病原框架变异NR0B1与先天性肾上腺假设相联
DAX1编码NR0B1上皮层和生殖轴开发期间拥有基本函数实验结果显示CAP病人电解扰动、低摄氏素和低睾固酮水平、等离子体累加活性并降低aldosterone水平十余名NR0B1变异报告,但其睾丸素水平已提高6..病人显示高水平睾固酮过早阴部估计会在病人生命的近未来观察选择适当的预防方法是一个关键步骤
中277NR0B1变异108框架移位218_219insACA小插件引向框架变换p.His73GlnfsX41,该变换法根据ACMG指南归为致病变换和预期的一样,该变异生成缺线蛋白并产生异常功能框架变换大都老时显示pheno类型
多报告先天性肾上腺增生15,16,但此案例首名病人 从伊朗CAP某些变异在某些人群中有独特的分布模式.例如,部分CYP21A2变异多组常见,但其中一些独有16..218_219INSACA可能拥有我们人口的祖先,因此建议进一步研究以澄清这一假设
基因测试对差分诊断PAI有帮助,因为异型病人可能导致误诊断NR0B1可能是伊朗子群中CAP常见原因早期诊断此失序可帮助处理
数据可用性
支持本研究发现的数据可应请求从相关作者处获取。
协议
知情同意由作者获取
利益冲突
作者声明无利益冲突
感知感知
向那些让作者记录故事 提高自身境遇的家庭 提供特殊嘉奖这项研究得到了德黑兰医科大学生长开发研究中心的支持,并得到了生长开发研究中心伦理委员会的批准。