ty -jour a2 -sakowicz,agata au -xie,hang au -zha,enfa au -Zhang,Yushun PY -2020 DA -2020/2020/11/28 Ti-急性心肌梗死 - 鉴定与代谢相关的基因的特征鉴定 -8880004 VL -2020 AB-
客观的。越来越多的新兴证据表明,代谢过程在急性心肌梗死(AMI)的生物过程中起关键作用。本研究的目的是使用支持矢量机(SVM)鉴定AMI患者中与代谢相关的基因,并进一步探索这些基因在AMI诊断中的价值。
方法。与AMI相关的基因微阵列表达数据是从基因表达综合(GEO)数据库中的GSE66360数据集下载的。该数据集由50个AMI样本和49个正常对照组成,这些对照被随机分类为发现队列(21个AMI样本和22个正常对照)和验证队列(28个AMI和28个正常对照)。我们应用了一种机器学习方法,该方法将SVM与递归功能消除(RFE)相结合,以区分AMI患者与正常对照。基于此,构建了SVM分类器。接收器操作特性(ROC)分析用于研究两个队列中AMI早期诊断的预测值,然后在独立的外部队列中进一步验证。
结果。基于SVM-RFE鉴定了三个与代谢相关的基因(
AKR1C3,,,,
格鲁, 和
PDE4B)。基于三个基因的SVM分类器允许在发现队列中对AMI和健康样品进行极好的区分(
AUC
=
0.989
)和验证队列(
AUC
=
0.964
),这在GSE68060数据集中得到了进一步证实(
AUC
=
0.839
)。此外,SVM分类器允许在GSE68060队列中进行反复的AMI事件和非重新事件的完美歧视(
AUC
=
0.992
)。GO和KEGG途径的富集分析对已鉴定的特征基因显示出明显的特定代谢途径的富集。
结论。已确定的与代谢相关的基因可能在AMI的发展中起重要作用,并且可能代表AMI的诊断和治疗生物标志物。SN -0278-0240 UR -https://doi.org/10.1155/2020/8880004 do -10.1155/2020/8880004 JF-疾病标记 - 疾病标记PB- Hindawi KW- ER- ER-