TY -的A2 - Chen Huiling盟——关,Yao-Zong盟——刘,浩盟——黄,Huan-Jie盟——梁、Dong-Yan盟——吴Si-Ying盟,张唐PY - 2022 DA - 2022/11/08 TI -识别潜在的分子机制TGFBI基因在持久性房颤SP - 1643674六世- 2022 AB -
背景。转化生长因子beta-induced蛋白质(TGFBI编码
TGFBI基因),是一种细胞外基质蛋白,广泛表达于多种组织。它与胶原蛋白结合类型I, II, IV和扮演着重要的角色在细胞与细胞之间的相互作用,胶原蛋白,矩阵。据报道与心肌纤维化有关,而后者是一个重要的pathophysiologyical心房颤动(房颤)的基础。然而,TGFBI在房颤机制仍不清楚。我们旨在检测的潜在机制
TGFBI通过生物信息学分析在房颤。
方法。GSE115574的微阵列数据集进行基因检测coexpressed
TGFBI从14房颤患者的左心室组织样本。
TGFBIcoexpression基因然后使用R筛选方案。使用在线分析工具,我们确定基因和基因组的京都百科全书(KEGG)通路富集分析,基因本体论(去)注释和蛋白质交互(PPI)的网络
TGFBI及其coexpression基因。模块和中心PPI-network被鉴定的基因。另一个数据集,GSE79768检查来验证中心的基因。DrugBank是用来探测目标药物的潜力。
结果。GSE115574数据集,共计1818 coexpression基因(769 1049积极和消极),120年丰富生物过程(BP), 38细胞组件(CC), 36分子功能(MF), 39 KEGG通路。PPI-network平均12.2度节点构造。的基因主要集中在顶部模块由这个网络在PI3K-Akt信号通路发挥作用,病毒性心肌炎,炎症性肠病、血小板激活。
CXCL12,
C3,
FN1,
COL1A2,
ACTB,
VCAM1,
MMP2最后验证被鉴定为中心的基因,主要富集在白细胞transendothelial迁移等途径,PI3K-Akt信号通路,病毒性心肌炎、风湿性关节炎、和血小板激活。Pegcetacoplan ocriplasmin,卡维地洛是潜在目标药物。
结论。我们使用microdataset来识别潜在的功能和机制
TGFBI及其coexpression房颤患者的基因。我们的研究表明,
CXCL12,
C3,
FN1,
COL1A2,
ACTB,
VCAM1,
MMP2可能是基因中心。SN - 1748 - 670 - 2022/1643674 / 10.1155 x你——https://doi.org/10.1155/2022/1643674——摩根富林明——计算和数学方法在医学PB - Hindawi KW - ER